Inicjatywa bp. Kazimierza Górnego, mająca na celu utworzenie w Pobitnie rektoratu pod wezwaniem bł. Józefa Sebastiana Pelczara w 1994 roku, stanowiła pierwszy krok ku samodzielności parafialnej tej dzielnicy. Rok później, dzięki dalszym staraniom biskupa, Pobitno uzyskało status niezależnej parafii, co zaznaczyło nowy rozdział w historii tego miejsca. Założenie to sprzyjało rozwojowi duchowemu i społecznemu mieszkańców, otwierając przed nimi nowe perspektywy i możliwości.
Z myślą o potrzebach rosnącej wspólnoty, już w roku utworzenia rektoratu, podjęto decyzję o budowie tymczasowej kaplicy, która została poświęcona jeszcze w grudniu 1994 roku. To szybkie działanie pokazało determinację i zaangażowanie lokalnych wiernych oraz duchowieństwa w tworzenie przestrzeni dla wspólnej modlitwy i spotkań.
Kolejnym krokiem w kształtowaniu parafii było rozpoczęcie prac nad budową kościoła parafialnego i zaplecza duszpasterskiego w 1999 roku, według projektu architekta Tadeusza Karysia. Prace te, trwające prawie dekadę, zaowocowały wzniesieniem świątyni, która stała się centrum życia religijnego i kulturalnego Pobitna. Poświęcenie nowego kościoła przez bp. Edwarda Białogłowskiego w grudniu 2008 roku było ważnym momentem, podkreślającym zakończenie etapu budowlanego i rozpoczęcie nowego etapu w historii parafii.
Wmurowanie kamienia węgielnego przez bp. Kazimierza Górnego w styczniu 2009 roku oraz konsekracja kościoła w czerwcu 2011 roku przez tego samego biskupa były wydarzeniami, które uroczyście zaznaczyły duchową i materialną obecność Kościoła w życiu mieszkańców Pobitna. Te wydarzenia nie tylko świadczą o rozwoju infrastruktury religijnej, ale także o głębokiej wierze i zaangażowaniu społeczności, która przyczyniła się do kształtowania tożsamości parafii.
Historia parafii w Pobitnie to przypomnienie o ciągłości tradycji i o tym, jak ważna jest praca i wiara ludzi w budowaniu wspólnoty. To także dowód na to, że nawet w zmieniających się czasach, miejsca te pozostają żywymi świadkami wiary i determinacji, przekazywanej z pokolenia na pokolenie.