Z inicjatywy bpa Ignacego Tokarczuka, Biskupa Przemyskiego, liderem nowopowstałej parafii został mianowany ks. Franciszek Kołodziej. Zabudowania gospodarcze przekształcono na tymczasową kaplicę, stanowiącą pierwszy etap rozwoju parafii, którą oficjalnie erygował bp Ignacy Tokarczuk 1 stycznia 1979 roku.
Nazwa kościoła „Podwyższenia Krzyża Świętego” niesie ze sobą pamięć o profanacji Krzyża, ustanowionego w 1933 roku przez mieszkańców Rzeszowa na znak 1900. rocznicy odkupienia i dla upamiętnienia mordu Polaków – uczestników Wiosny Ludów 1848 roku. Rozbudowa osiedla Baranówka oraz powstanie trzech dużych szkół ujawniły potrzebę budowy nowego kościoła, by sprostać rosnącym potrzebom duszpasterskim.
Mimo licznych trudności i przeszkód ze strony władz świeckich, społeczność parafialna wraz z proboszczem podjęła odważny krok rozpoczęcia prac budowlanych bez formalnego zezwolenia. 2 maja 1987 roku, ks. prałat Józef Mucha dokonał poświęcenia placu pod budowę kościoła, domu katechetycznego oraz plebanii, co stało się ważnym momentem w historii parafii.
Dekadę po założeniu parafii, 22 maja 1988 roku, ks. dziekan Józef Sondej poświęcił kaplicę i dom katechetyczny. Kontynuowano prace przy wznoszeniu nowego kościoła, zaprojektowanego przez architekta Rubena Bardanaszwiliego z Krosna. 20 maja 1993 roku, świątynia została poświęcona przez bpa Kazimierza Górnego, a 14 września 2003 roku miała miejsce uroczysta konsekracja przez tegoż biskupa.
Rok 2011 przyniósł remont domu parafialnego, a lata 2013-2015 to czas gruntownego remontu kościoła, zarówno wewnątrz, jak i na zewnątrz, co świadczy o ciągłym rozwoju i dbałości o miejsce kultu religijnego.